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杜向军 教授

   
杜向军 教授(博士生导师)
国家青年千人、中山大学百人计划引进人才
电子邮箱
: duxj9@mail.sysu.edu.cn
 
研究方向

1. 生物信息学/计算系统生物学

2. 传染病病原体演化

3. 传染病理论建模

4. 宿主感染免疫机制与定量模拟





   
工作经历   
     2018/01 - 至今      中山大学公共卫生学院(深圳),教授
     2015/12-2017/12  
芝加哥大学生态进化系,研究专员
     2015/04-2015/11   芝加哥大学生态进化系,研究助理
     2014/10-2015/11   霍华德休斯医学研究所(HHMI),研究助理
     2014/10-2015/03   密歇根大学生态与进化生物学系,研究助理
     2010/09-2014/09   美国国立卫生院(NIH)国立生物信息学中心(NCBI),博后


    教育经历 
     2005/09-2010/07   中国科学院生物物理研究所,生物信息学,理学博士 
2001/09-2005/07   华中科技大学物理系,应用物理学,理学学士。

主要承担课题及人才项目
1. 中组部青年千人计划(已公示),2018
2. 中山大学百人计划,2017

发表文章

到目前为止共发表学术论文11篇,其中以第一作者在Science Translational Medicine、Nature Communication、Genome Research、Nucleic Acids Research、Genome Biology and Evolution等主流国际学术期刊共发表论文6篇,平均影响因子大于10,以通讯作者发表文章一篇,代表文章如下(*通讯作者):

1. Xiangjun Du*, Mercedes Pascual. Incidence prediction for the 2017-2018 influenza season in the United States with an evolution-informed model. PLoS Currents Outbreaks. January 17 (2018)
2. Xiangjun Du, Aaron A. King, Robert J. Woods, Mercedes Pascual*. Evolution-informed forecasting of seasonal influenza A (H3N2). Science Translational Medicine, 9(413) (2017)
3. Yousong Peng, Lei Yang, Honglei Li, Yuanqiang Zhou, Lizong Deng, Aiping Wu, Xiangjun Du, Dayan Wang, Yuelong Shu*, Taijiao Jiang*. PREDAC-H3: A User-friendly Platform for Antigenic Surveillance of Human Influenza A (H3N2) Virus Based on Hemagglutinin Sequence. Bioinformatics, 32(16):2526-2527 (2016)
4. Mi Liu, Xiang Zhao, Sha Hua, Xiangjun Du, Yousong Peng, Xiyan Li, Yu Lan, Dayan Wang, Aiping Wu, Yuelong Shu*, Taijiao Jiang*. Antigenic Patterns and Evolution of the Human Influenza A (H1N1) Virus. Scientific Reports, 5:14171 (2015)
5. Xiangjun Du, E. Michael Gertz, Damian Wojtowicz, Dina Zhabinskaya, David Levens, Craig Benham, Alejandro A. Schaffer*, and Teresa Przytycka*. Potential non-B DNA Regions in the Human Genome are Associated with Higher Rates of Nucleotide Mutation and Expression Variation. Nucleic Acids Research, 42(20):12367-79 (2014)
6. Xiangjun Du, Damian Wojtowicz, Albert A. Bowers, David L. Levens, Craig J. Benham and Teresa M. Przytycka*. The Genome-wide Distribution of Non-B DNA Motifs is Shaped by Operon Structure and Suggests the Transcriptional Importance of Non-B DNA Structures in Escherichia coli. Nucleic Acids Research 41(12):5965-77 (2013)
7. Xiangjun Du, David J. Lipman and Joshua L. Cherry*. Why Does a Protein’s Evolutionary Rate Vary over Time? Genome Biology and Evolution, 5:494-503 (2013)
8. Xiangjun Du, Libo Dong, Yu Lan, Yousong Peng, Aiping Wu, Ye Zhang, Weijun Huang, Dayan Wang, Min Wang, Yuanji Guo, Yuelong Shu*, Taijiao Jiang*. Mapping of H3N2 Influenza Antigenic Evolution in China Reveals a Strategy for Vaccine Strain Recommendation. Nature Communications 3:709 (2012).
9. Yang Cao, Xiaoying Koh, Libo Dong, Xiangjun Du, Aiping Wu, Xilai Ding, Hongyu Deng, Yuelong Shu*, Jianzhu Chen*, Taijiao Jiang*. Rapid Estimation of Binding Activity of Influenza Virus Hemagglutinin to Human and Avian Receptors. PLoS ONE 6(4): e18664 (2011).
10. Aiping Wu, Yousong Peng, Xiangjun Du, Yuelong Shu, Taijiao Jiang*. Correlation of Influenza Virus Excess Mortality with Antigenic Variation: Application to Rapid Estimation of Influenza Mortality Burden. PLoS Computational Biology 6(8): e1000882 (2010).
11. Xiangjun Du, Zhuo Wang, Aiping Wu, Lin Song, Yang Cao, Haiying Hang, Taijiao Jiang*. Networks of genomic co-occurrence capture characteristics of human influenza A (H3N2) evolution. Genome Research 18:178-187 (2008).
 

   发明专利

   1.通过模型预测流感抗原的方法及应用,2012年,发明专利,专利号:ZL201010147536.8;

 

   获奖情况

   1.NIH Fellows Award for Research Excellence, 2012


招生信息
接收本科生2-3人/年进行科研培训,招收博士生、硕士生3-4人/年,常年招收博士后以及专职科研(研究员、副研究员、助理研究员以及研究助理)。欢迎对生物信息学、计算系统生物学、数据分析、演化、流行病学建模、感染免疫机制以及网络动力学等领域感兴趣的生物、物理、数学以及计算机方向的博士后、研究生和本科生加入我们的研究小组!联系人:杜向军 联系方式:
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